MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017578	ATT	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017578	A	6	6	4106	4111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017578	ACG	2	6	4123	4128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017578	T	7	7	4134	4140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017578	ATG	2	6	4150	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017578	A	6	6	4166	4171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017578	T	7	7	4249	4255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017578	AC	4	8	4256	4263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017578	AAT	2	6	4285	4290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017578	GCC	2	6	4338	4343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017578	TCA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017578	TGACAA	2	12	4366	4377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017578	TAA	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017578	A	7	7	4431	4437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017578	GTT	2	6	4465	4470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017578	ACCAA	2	10	4879	4888	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017578	GTTA	2	8	5303	5310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017578	AAAACA	2	12	5943	5954	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017578	ATA	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017578	GAT	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017578	AAC	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017578	AC	3	6	6545	6550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017578	AG	3	6	6699	6704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017578	CAA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017578	ATGG	2	8	9671	9678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017578	A	7	7	10237	10243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017578	A	6	6	10271	10276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017578	ACG	2	6	10288	10293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017578	T	7	7	10299	10305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017578	GATAT	2	10	10307	10316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017578	ATT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017578	CA	3	6	10384	10389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017578	A	9	9	10892	10900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017578	TGC	2	6	10904	10909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017578	AGC	2	6	10946	10951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017578	AAC	2	6	10969	10974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017578	TAT	2	6	11846	11851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017578	TAA	2	6	11852	11857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017578	TCA	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017578	ATT	2	6	11947	11952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017578	AAC	2	6	12023	12028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017578	ATA	2	6	12168	12173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017578	CTAA	2	8	13612	13619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017578	A	6	6	13618	13623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017578	TTAA	2	8	13718	13725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017578	TGC	2	6	13961	13966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017578	AGCAG	2	10	14019	14028	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017578	AAT	2	6	14152	14157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017578	TGAAC	2	10	14215	14224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017578	TCA	2	6	14261	14266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017578	GAA	2	6	14276	14281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017578	T	6	6	14320	14325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017578	CA	3	6	14328	14333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017578	A	7	7	14936	14942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017578	ACA	2	6	14988	14993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017578	TTC	2	6	15007	15012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017578	TAAG	2	8	15041	15048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017578	GATT	2	8	15070	15077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017578	GTA	2	6	15083	15088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017578	AAT	2	6	15134	15139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017578	GA	3	6	15178	15183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017578	ATC	2	6	17479	17484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017578	TAA	2	6	17541	17546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017578	ATG	2	6	17559	17564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017578	ATC	2	6	17636	17641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017578	CCA	2	6	17679	17684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017578	CCTT	2	8	20703	20710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017578	GTTA	2	8	20716	20723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017578	A	6	6	20729	20734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017578	ATA	2	6	20823	20828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017578	ATA	2	6	20831	20836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017578	ATA	2	6	20869	20874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017578	AAC	2	6	20997	21002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017578	AGC	2	6	21098	21103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017578	TCA	2	6	21203	21208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017578	CG	3	6	21271	21276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017578	GAA	2	6	21381	21386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017578	ATT	2	6	21457	21462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017578	ATTC	2	8	22297	22304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017578	TGT	3	9	22341	22349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017578	A	6	6	22383	22388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017578	TTC	2	6	22391	22396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017578	CTT	2	6	22459	22464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017578	TAACC	2	10	22493	22502	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017578	TCA	2	6	22518	22523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017578	TAG	2	6	22529	22534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017578	TTC	2	6	22545	22550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017578	C	7	7	22599	22605	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_017578	T	6	6	22619	22624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017578	TAAT	2	8	22650	22657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017578	TGA	2	6	22659	22664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017578	ATT	2	6	22670	22675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017578	T	6	6	22736	22741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017578	CGA	2	6	22771	22776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017578	ATA	2	6	22917	22922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017578	GAC	2	6	22940	22945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017578	TCA	2	6	22947	22952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017578	T	6	6	23025	23030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017578	GAT	2	6	23032	23037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017578	TTG	2	6	23088	23093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017578	ATT	2	6	23110	23115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017578	AAT	2	6	24813	24818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017578	AGC	2	6	24842	24847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017578	CCG	2	6	24939	24944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017578	A	6	6	24992	24997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017578	GTT	2	6	25011	25016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017578	TCG	2	6	25139	25144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017578	TTC	2	6	25187	25192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017578	ACG	2	6	25254	25259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017578	CGC	2	6	25382	25387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017578	TTG	2	6	25433	25438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017578	TCG	2	6	25668	25673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017578	TGC	2	6	25710	25715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017578	A	6	6	25789	25794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017578	ATC	2	6	25805	25810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017578	AAC	2	6	25847	25852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017578	AGG	2	6	25857	25862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017578	GAT	2	6	25911	25916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017578	AAT	2	6	25984	25989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017578	CTA	2	6	26037	26042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017578	CTTT	2	8	26989	26996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017578	T	6	6	26994	26999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017578	TAA	2	6	27045	27050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017578	ACA	2	6	27084	27089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017578	TAA	2	6	27096	27101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017578	ATT	2	6	27107	27112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017578	TAAGA	2	10	27119	27128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017578	TAC	3	9	27134	27142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017578	TTTA	2	8	27161	27168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017578	GTC	2	6	27184	27189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017578	A	6	6	27272	27277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017578	T	7	7	27327	27333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017578	AAC	2	6	27335	27340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017578	GAA	2	6	27418	27423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017578	GCA	2	6	27568	27573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017578	AGA	2	6	27586	27591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017578	CTT	2	6	27694	27699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017578	GA	3	6	27703	27708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017578	TCA	2	6	27728	27733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017578	GAA	2	6	27916	27921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017578	AAGG	2	8	27929	27936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017578	TCGT	2	8	27957	27964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017578	AGC	2	6	27990	27995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017578	GTGAC	2	10	28106	28115	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017578	GTG	2	6	28152	28157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017578	TAA	2	6	28234	28239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.